第349集到353集是自来也和佩恩六道决战的**部分，377集到389集，是木叶村众人决战佩恩六道的第二部分。
1、自来也VS佩恩六道（349集到353集）
剧情简介：自来也使出仙人模式，召来两位蛤蟆仙人（深作及志麻大人）相助，成功打败了三个佩恩，结果由于大意以及不了解佩恩六道的相关情报，所以不幸被打败而牺牲。但临死前自己查出了佩恩六道及其本体的秘密（都是自己曾经遇到的忍者，六道均为尸体傀儡，受长门操控）。
自来也临死前回忆起跟波风水门及漩涡玖辛奈的对话，水门从自来也著作《毅力忍传》中为他们的儿子取名字曰鸣人。自来也又回忆起自己一生失败之事，并说出鸣人才是“预言之子”（后经大蛤蟆仙人亲自证实，长门和鸣人都是预言之子），因鸣人也正有那种绝不轻易放弃的毅力。
在千钧一发之际，自来也把关于佩恩的情报用指刻封印写在深作仙人的背上叫其带回木叶村。佩恩五道也向自来也进行反扑，*后被佩恩五道打入水底，而蛤蟆仙人深作则成功逃回木叶。
2、木叶村众人VS佩恩六道（377集到389集）
剧情简介：佩恩和小南一起**木叶捕捉九尾人柱力——漩涡鸣人。修罗道、畜生道、饿鬼道分为*敌组；天道、人间道、地狱道和小南为探索组，开始了**。期间与卡卡西交战，并**了卡卡西，在用人间道得知了鸣人在妙木山后；
控制天道来到木叶上空，然后用畜生道将修罗道、人间道、饿鬼道、地狱道还有小南通灵到木叶村外，不惜以缩短寿命的代价，执意使用神罗天征将整个木叶隐村摧毁！之后佩恩六道与从妙木山赶回来的漩涡鸣人交战。
佩恩六道被漩涡鸣人逐个击败后，鸣人在小南用纸制作的一棵大树里找到了佩恩的本体——长门，两位预言之子终于相遇。
鸣人想要知道长门的过去，并想从长门的经历找出和平的答案。长门将父母之死及挚友弥彦之死一生两大痛楚向鸣人讲述后，鸣人拿出了自来也写的**本书《毅力忍传》。毅力忍传的写作灵感来源于自来也的一个弟子，这个弟子正是长门。
鸣人与长门一番对话后，长门被其永不放弃的意志所打动，决心将促成和平的愿望交付鸣人。长门使用了禁术—外道‧轮回天生之术令木叶所有死亡者复活（包括卡卡西），却牺牲了自己的*命。
而小南把长门及弥彦的遗体带走，同样把希望托付给鸣人。鸣人决意继承师父（自来也）及师兄（长门）的遗愿。
《火影忍者》鸣人打佩恩是383到389集。
佩恩蓄谋已久，带领晓组织攻打木村的行动中，战斗中的佩恩细节展现六具身体，鸣人对战被迫初次开启仙人模式。在佩恩**木叶村时，众忍者们纷纷出手，与佩恩展开大战，没想到卡卡西、木叶丸等全都败在佩恩手上，后来鸣人以一己之力对抗佩恩六道，毁了天道并将佩恩打败。
佩恩六道分为天道、修罗道、人间道、畜生道、饿鬼道、地狱道，不*悉六道属*的人很容易被他算计，鸣人的师父自来也就是因此丧命，所以鸣人与佩恩之间有着血海深仇，佩恩来**木叶村，正好撞在鸣人的枪口上，也算是自寻死路。
《火影忍者》是****家岸本齐史的创作的热血冒险类**。讲述身为孤儿的漩涡鸣人，他的父母为了保护村子，将**村子的九尾妖狐封印到了他体内，鸣人因此受尽了村人的冷落，但他依然想通过恶作剧来得到大家的注意。庆幸的是遇到了好的老师跟朋友，于是他依然凭借自己的乐观和一腔热血创造了属于自己的时代。
作品于1999年开始在《周刊少年JUMP》上连载，电子版由漫番**连载，于2014年11月10日发售的JUMP第50号完结；后日谈*质的外传**《火影忍者外传：第七代火影与绯色花月》则于同杂志2015年第22、23合并号开始短期连载，至同年第32号完结。
1、为替自来也**，他决定接受深作大人的提议，前往自来也曾修行的妙木山，作艰苦的“仙术”训练。经过一番修行，鸣人总算是基本掌握了自然力量，深作将自来也的遗作——《坚毅忍传》交给鸣人。
2、鸣人在九尾怂恿下准备揭开封印之时，四代封印的查克拉现身阻止，鸣人才得知自己的身世，四代与鸣人交谈后重新封印九尾，并消失。
3、鸣人脱离地爆天星的束缚，打败天道，并用逆向探查找到佩恩本体——长门。与鸣人的交谈中，长门被鸣人感化。
4、放弃原定计划，决定将梦想托付给鸣人，期盼鸣人能够完成几代人的使命，之后因施展外道·轮回天生之术复活卡卡西、静音、深作等所有**而耗尽生命。鸣人送走小南，回到木叶。
5、参考资料来源：百度百科-火影忍者
1、火影忍者中鸣人打败佩恩是在TV版的第394集中。
2、关于火影忍者中佩恩**木叶的剧情中，鸣人登场是从TV版本第383集开始，一直到第394集结束，总共有着12集的剧情，在*后长门被鸣人说服，选择使用了轮回天生之术。
3、十多年前一只**的尾兽“九尾妖狐”**了木叶隐村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。
4、木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成怪物看待，所有人都疏远他。无可奈何，鸣人用各种恶作剧试图吸引大家的注意力。
5、在伊鲁卡老师的关心下，鸣人始终保持着乐观的精神。为了让更多的人认可自己，他下定决心要成为火影！鸣人怀着过人的自信与勇气开始了训练，但一切要比他想象的要困难的多。鸣人从小十分孤独，木叶村村民把他当成九尾的化身，当他是怪物看待。
1、剧情简介：鸣人在察觉到情况有异后，便与深作一同赶回木叶。但出现在他眼前的，竟是已被破坏殆尽的木叶忍者村。纲手也为了保护村民的*命，用尽了所有的查克拉。于是鸣人强忍住愤怒与悲痛奋不顾身地与佩恩展开一场激烈的对战！
2、剧情简介：经过几回合的激烈战斗，鸣人用风遁·螺旋手里剑成功**了佩恩人间道，但其他的培因也陆陆续续的在他面前站了起来。深作跟志摩为了切断轮回眼的联击而展开行动！就在此时，鸣人从仙人模式中解除的危机，正一分一秒地逼近…
3、剧情简介：激战过后，鸣人遭到了天道的压制，虽然他想用仙人模式对抗，但查克拉却被饿鬼道吸收，使得仙术模式遭到强制解除。另一方面，为了不让静音白白牺牲，鹿丸等人誓言找出培因的本体，正当他们在分析情资时，山中亥一发现了一项重大的事实…
4、剧情简介：在深作与志摩陆续倒下后，鸣人的行动终于被天道给控制住了。就在一筹莫展之际，雏田为了守护鸣人决定挺身而战。另一方面，阿凯小组正快马加鞭赶回木叶，而宁次也在那个时候，感受到前方有某种不寻常的异状…
5、剧情简介：鸣人受到雏田在自己眼前倒下的冲击，使得九尾的查克拉开始暴走，但有能力阻止九尾失控状态的大和，却正在远方出任务。九尾鸣人和天道展开了一场激烈的厮杀，在这场超越人们认知的战斗中，鸣人尾巴的数量终于来到了八根…
6、剧情简介：鸣人在精神世界里与第四代火影——波风凑相遇。在受到父亲的鼓舞之后，鸣人心中的迷惘也随之烟消云散，并下定决心要找到自来也所托付的答案，随后便回到了培因正在等他现身的现实世界…
7、剧情简介：为了切断憎恨的连锁，鸣人打算前往培因本体的藏身之处，没想到却在途中与四角等人相逢。面对鸣人想独自去与培因本体对谈的要求，虽然众人并不赞同，却也决定尊重鸣人的想法，而鸣人也终于见到了师出同门的师兄——长门…
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